›› 2012, Vol. 55 ›› Issue (10): 1193-1204.doi:
迟美妍, 韩辉林, 高强, 杨聪慧, 金倩, 李俊, 陈付强, 武春生, 张爱兵
CHI Mei-Yan, HAN Hui-Lin, GAO Qiang, YANG Cong-Hui, JIN Qian, LI Jun, CHEN Fu-Qiang, WU Chun-Sheng, ZHANG Ai-Bing
摘要: 为了探究进化模型对DNA条形码分类的影响, 本研究以雾灵山夜蛾科44个种的标本为材料, 获得COI基因序列。使用邻接法(neighbor-joining)、 最大简约法(maximum parsimony)、 最大似然法(maximum likelihood)以及贝叶斯法(Bayesian inference)构建系统发育树, 并且对邻接法的12种模型、 最大似然法的7种模型、 贝叶斯法的2种模型进行模型成功率的评估。结果表明, 邻接法的12种模型成功率相差不大, 较稳定; 最大似然法及贝叶斯法的不同模型成功率存在明显差异, 不稳定; 最大简约法不基于模型, 成功率比较稳定。邻接法及最大似然法共有6种相同的模型, 这6种模型在不同的方法中成功率存在差异。此外, 分子数据中存在单个物种仅有一条序列的情况, 显著降低了模型成功率, 表明在DNA条形码研究中, 每个物种需要有多个样本。