›› 2004, Vol. 47 ›› Issue (5): 573-578.
王小纯1,2, 张珈敏1, 蒋洪1, 俞海洋1, 谭莉1, 胡远扬1*
WANG Xiao-Chun1,2, ZHANG Jia-Min1, JIANG Hong1, YU Hai-Yang1, TAN-Li1, HU Yuan-Yang1*
摘要: 用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropis oblique小RNA病毒(EoPV)中提取病毒基因组RNA,逆转录后加poly(dT),然后进行两步PCR扩增基因组5′端。克隆测序后,对其5′端非编码区的核苷酸序列进行分析,发现具有哺乳动物小RNA病毒的5′端非编码区的一些特征:A/T含量丰富、起始密码子上游AUG和小顺反子多。利用mfold预测了EoPV 5′端非编码区的二级结构,存在4个茎环结构,有哺乳动物内部核糖体进入位点(IRES)的保守区域,即含保守基序GNRA的茎环A和A/C丰富的环B及多聚嘧啶区域。据此推测EoPV基因组翻译采用IRES起始机制。