昆虫学报 ›› 2016, Vol. 59 ›› Issue (7): 767-774.doi: 10.16380/j.kcxb.2016.07.009
魏书军1,*, 李冰艳1,2, 曹利军1, 朱家颖2
WEI Shu-Jun1,*, LI Bing-Yan1,2, CAO Li-Jun1, ZHU Jia-Ying2
摘要: 限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing, RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing, RRGS)。RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段化,经过修饰后连接含标记的接头构建文库并进行测序。因其具有操作简单、实验成本低、通量高等优点,在分子生态学、进化基因组学、保护遗传学等领域得到应用。目前发展起来的RAD-seq技术主要包括利用稀有酶和物理打断方式进行基因组片段化的mbRAD、利用稀有酶和常见酶组合酶切的方式进行基因组片段化的ddRAD、利用IIB型限制性内切酶得到短片段文库的2bRAD、利用同裂酶和Illumina试剂盒建库的ezRAD和完全利用Nextera试剂盒建库的nextRAD。本文对每种RAD-seq技术的特点及其在昆虫种群遗传学、群落生态学、物种界定、系统发育和遗传连锁图谱构建等研究领域的应用进行了综述。