›› 2011, Vol. 54 ›› Issue (7): 739-745.doi:
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邹朗云, 曹广春, 张谦, 张彦, 梁革梅, 吴孔明, 郭予元
ZOU Lang-Yun, CAO Guang-Chun, ZHANG Qian, ZHANG Yan, LIANG Ge-Mei, WU Kong-Ming, GUO Yu-Yuan
摘要: 中肠是苏云金芽孢杆菌Bacillus thuringiensis (Bt)发挥作用的主要部位, 中肠上很多蛋白被认为是Bt毒素的结合蛋白。为了探索棉铃虫Helicoverpa armigera对Bt的抗性机制, 我们运用RNA转录过程中的5′末端转换机制(Switching Mechanism at 5′ end of the RNA Transcript, SMART)技术构建了棉铃虫中肠的cDNA文库。先提取棉铃虫5龄幼虫中肠组织的总RNA, 合成双链cDNA, 经过均一化处理后, 酶切、 连接载体、 转化到大肠杆菌Escherichia coli感受态细胞, 最后进行滴度测试、 文库扩增并进行EST序列测定。对该文库质量分析表明: 文库滴度为2×106 pfu/mL, 重组率为100%, 平均插入片段大于1 kb, 全长率为50%。最终成功得到1 098条表达序列标签(expressed sequence tags, ESTs) 序列, 经Phrap程序聚类拼接后得到789条单基因簇(unigene), 包括132个重叠群(congtigs) 和657个单拷贝(singlets)。将聚类拼接后的789条ESTs序列在NT, NR和SWISSPORT库中进行本地化搜索, 比对后发现: 218条序列(27.62%) 没有注解; 119条序列(15.08%)注解不明确; 452条序列(57.29%)有功能注解, 并表达300多种基因产物。构建的文库各项指标均达到要求, 该文库的构建为棉铃虫中肠各类基因的克隆及功能分析奠定了基础。